12月22日　公务机要费案二度开庭 扁嫂吴淑珍请假不出庭。虽然吴淑珍不出庭，合议庭仍将就马永成等其它三名被告部分，继续进行准备程序及争点整理。

　　12月15日　"国务机要费"案首次开庭 陈水扁夫人吴淑珍等多人出庭应讯。检、辩双方均阵容强大。

　　11月3日 台 北“地检署”侦结“公务机要费”案，吴淑珍、马永成、陈镇慧、林德训以贪污罪条例起诉。

　　10月12日 “台湾红”负责人李慧芬在“立法院”“总统罢免案”审查会作证。

　　9月21日 约谈陈水扁随扈与吴淑珍亲友、同学等20人，追查案情。

　　9月中旬 约谈李登辉查证“公务机要费”用途。

　　9月7日 陈水扁办公室及“高检署”证实，检查官陈瑞仁于8月7日及20日分别就讯陈水扁和吴淑珍。

　　8月24日 “查黑中心”传唤12名有消费发票进入陈水扁办公室“公务机要费”帐册的证人，追查为何发票会流入陈水扁办公室。部分证人称，不知道自己消费的发票被陈水扁办公室拿去使用，怀疑由商店直接提供陈水扁办公室。

　　8月16日 李碧君与李慧芬对质，否认曾亲手将发票交给吴淑珍。

　　8月14日 李慧芬自澳洲返台至“查黑中心”作证，并证称李碧君向她要发票，都是要交给吴淑珍的。

　　8月9日 “查黑中心”约谈杏林新生制药负责人李碧君，她坦承，向李慧芬索讨君悦饭店发票，但不知为何流入陈水扁办公室。李碧君讯后遭检调限制出境，并列为被告。

　　7月31日 “查黑中心”查扣近6年“公务机要费”单据。

　　7月25日“查黑中心”约谈杏林新生制药负责人李碧君，她坦承，向李慧芬索讨君悦饭店发票，但不知为何发票流入陈水扁办公室。李碧君讯后遭检调限制出境，并列为被告。

　　7月10日检调约谈台“总统府”前副秘书长马永成就“公务机要费”案说明。

　　6月29日 “高检署黑金中心”根据先前接获的检举内容分案完成，由检察官陈瑞仁调查“公务机要费”流向。

　　6月28日“审计部”派员赴 陈水扁办公室查账，事后将疑涉不法相关资料函送“高检署黑金中心”调查。

　　6月12日 “台湾红”负责人李慧芬向国民党“立委”邱毅爆料，她的300万新台币君悦饭店住宿发票，被堂姐李碧君拿去转交吴淑珍核销“公务机要费”。