选前吵得不可开交的“公投绑大选”，如期举行，但选民以极低投票率表达强烈的态度。“入联公投”（第五案）投票率35.82%，有6201677人领投；有效票中的“同意”比率为94.01%、5529230票，“不同意”比率5.99%、352359票。

“返联公投”（第六案）的投票率为35.74%，投票人数6187118人；有效票中的“同意”票比率87.27%，为4962309票，“不同意”票为12.73%、724060票。

台湾共进行了三次“公投”，总共六案。二○○四年“大选”，陈水扁首次发动“是否同意政府增加购置反飞弹装备”，以及“是否同意政府与中共谈判，建立两岸和平稳定的交互架构”的“公投”。但投票率都只有45%，没能跨过50%的投票率门槛，全被否决。

今年初“立委”选举，民进党再发动“讨国民党党产公投”，国民党也针对陈水扁涉及贪腐犯行，发动“反贪腐公投”，但投票率也各自只有26.34%及26.08%，同样遭到否决。

这次由民进党发动的“入联公投”，共有588万张有效票，和“总统”选举中长昌的得票数544万票非常接近。回顾过去四次“公投”，性质和入联最接近的，要属于○四年“大选”的“增购反飞弹装备公投”，赞成票数为651万，比昨天长昌的得票还高，显见藉“公投”为“大选”催票的效力，正在逐步递减。

“中选会”主委张政雄指出，三月二十八日的委员会议将审定、公告“公投”案投票结果。“公投法”第三十条明定，全台性“公民投票”案投票结果，投票人数达全台投票权人总数二分之一以上，且有效投票数超过二分之一同意者，即为通过，未达这两个条件，即被否决。

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