湄洲祖庙祭祀大典于清代编入国家祀典，与陕西省黄陵县黄帝陵祭典、山东省曲阜市祭孔大典并称为"中华三大祭典"。为弘扬中华传统文化，将妈祖祭仪引向规范，1994年参照历史资料和民俗祭仪制定《湄洲祖庙祭典》。近几年又对祭奠乐舞进行艺术加工，以期宗教祭礼兴艺术观赏完美结合。

湄洲妈祖祖庙祭典自成一体，历史悠久影响深远，已列入首批国家级非物质文化遗产名录加以保护。